MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Mycobacterium bovis BCG str. Pasteur 1173P2 chromosome

Total Repeats: 108976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008769	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635884
2	NC_008769	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635884
3	NC_008769	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
4	NC_008769	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
5	NC_008769	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635884
6	NC_008769	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
7	NC_008769	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635884
8	NC_008769	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635884
9	NC_008769	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	121635884
10	NC_008769	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
11	NC_008769	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635884
12	NC_008769	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
13	NC_008769	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121635884
14	NC_008769	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	121635884
15	NC_008769	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635884
16	NC_008769	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	121635884
17	NC_008769	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	121635884
18	NC_008769	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	121635884
19	NC_008769	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635884
20	NC_008769	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
21	NC_008769	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121635884
22	NC_008769	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121635884
23	NC_008769	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	121635884
24	NC_008769	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	121635884
25	NC_008769	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
26	NC_008769	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635884
27	NC_008769	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
28	NC_008769	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635884
29	NC_008769	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	121635884
30	NC_008769	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635884
31	NC_008769	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635884
32	NC_008769	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	121635884
33	NC_008769	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635884
34	NC_008769	TTC	2	6	1534	1539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008769	A	7	7	1553	1559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008769	TC	4	8	1562	1569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008769	CGG	2	6	1643	1648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008769	AC	4	8	1686	1693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008769	CCGA	2	8	1725	1732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008769	TCG	2	6	1801	1806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008769	ACC	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008769	TCG	2	6	1866	1871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008769	ATG	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008769	GTT	3	9	1925	1933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008769	CTG	2	6	1937	1942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008769	CGT	2	6	1950	1955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008769	TCG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008769	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	121635885
49	NC_008769	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	121635885
50	NC_008769	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	121635885
51	NC_008769	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121635885
52	NC_008769	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635885
53	NC_008769	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635885
54	NC_008769	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635885
55	NC_008769	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635885
56	NC_008769	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635885
57	NC_008769	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	121635885
58	NC_008769	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	121635885
59	NC_008769	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635885
60	NC_008769	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635885
61	NC_008769	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635885
62	NC_008769	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635885
63	NC_008769	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635885
64	NC_008769	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635885
65	NC_008769	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	121635885
66	NC_008769	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635885
67	NC_008769	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121635885
68	NC_008769	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	121635885
69	NC_008769	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635885
70	NC_008769	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	121635885
71	NC_008769	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121635885
72	NC_008769	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635885
73	NC_008769	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	121635885
74	NC_008769	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	121635885
75	NC_008769	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635885
76	NC_008769	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	121635885
77	NC_008769	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	121635886
78	NC_008769	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635886
79	NC_008769	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635886
80	NC_008769	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	121635886
81	NC_008769	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635886
82	NC_008769	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635886
83	NC_008769	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121635886
84	NC_008769	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121635886
85	NC_008769	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635886
86	NC_008769	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	121635886
87	NC_008769	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635886
88	NC_008769	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121635886
89	NC_008769	GTG	2	6	3748	3753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635886
90	NC_008769	GT	3	6	3812	3817	0 %	50 %	50 %	0 %	121635886
91	NC_008769	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635886
92	NC_008769	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	121635886
93	NC_008769	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121635886
94	NC_008769	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635886
95	NC_008769	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635886
96	NC_008769	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635886
97	NC_008769	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635886
98	NC_008769	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635886
99	NC_008769	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635886
100	NC_008769	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635886
101	NC_008769	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635886
102	NC_008769	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635886
103	NC_008769	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635886
104	NC_008769	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635886
105	NC_008769	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635886
106	NC_008769	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635887
107	NC_008769	CG	5	10	4542	4551	0 %	0 %	50 %	50 %	121635887
108	NC_008769	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	121635887
109	NC_008769	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635887
110	NC_008769	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635887
111	NC_008769	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635887
112	NC_008769	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635887
113	NC_008769	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635887
114	NC_008769	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635887
115	NC_008769	CG	3	6	4978	4983	0 %	0 %	50 %	50 %	121635887
116	NC_008769	GAA	2	6	5091	5096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008769	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121635888
118	NC_008769	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
119	NC_008769	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635888
120	NC_008769	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121635888
121	NC_008769	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121635888
122	NC_008769	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
123	NC_008769	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635888
124	NC_008769	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635888
125	NC_008769	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635888
126	NC_008769	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	121635888
127	NC_008769	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	121635888
128	NC_008769	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
129	NC_008769	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635888
130	NC_008769	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
131	NC_008769	CGGCGT	2	12	5602	5613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121635888
132	NC_008769	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
133	NC_008769	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	121635888
134	NC_008769	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121635888
135	NC_008769	ACGGT	2	10	5747	5756	20 %	20 %	40 %	20 %	121635888
136	NC_008769	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	121635888
137	NC_008769	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121635888
138	NC_008769	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635888
139	NC_008769	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635888
140	NC_008769	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
141	NC_008769	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635888
142	NC_008769	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635888
143	NC_008769	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	121635888
144	NC_008769	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121635888
145	NC_008769	AAGGAC	2	12	6254	6265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	121635888
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147	NC_008769	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121635888
148	NC_008769	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	121635888
149	NC_008769	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121635888
150	NC_008769	GC	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	121635888
151	NC_008769	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121635888
152	NC_008769	ACG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635888
153	NC_008769	TGT	2	6	6867	6872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635888
154	NC_008769	GTT	3	9	6877	6885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121635888
155	NC_008769	CCG	2	6	6935	6940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635888
156	NC_008769	CTG	2	6	7007	7012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121635888
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158	NC_008769	CAA	2	6	7042	7047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121635888
159	NC_008769	ACC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121635888
160	NC_008769	GT	3	6	7131	7136	0 %	50 %	50 %	0 %	121635888
161	NC_008769	GAC	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635888
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167	NC_008769	GAC	2	6	7326	7331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635889
168	NC_008769	CAG	2	6	7362	7367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635889
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172	NC_008769	CGGT	2	8	7524	7531	0 %	25 %	50 %	25 %	121635889
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226	NC_008769	CGA	3	9	9605	9613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121635889
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234	NC_008769	CGA	3	9	9830	9838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
235	NC_008769	GAG	2	6	9859	9864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
236	NC_008769	CGC	2	6	10041	10046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121635890
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257	NC_008769	TCG	2	6	10862	10867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_008769	TCC	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_008769	ACG	2	6	10977	10982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_008769	GGC	2	6	11022	11027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_008769	TCG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_008769	CCT	2	6	11083	11088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_008769	ACCCG	2	10	11279	11288	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
264	NC_008769	CGG	2	6	11320	11325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_008769	ACG	2	6	11382	11387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_008769	ACC	2	6	11425	11430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
267	NC_008769	ACC	3	9	11495	11503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_008769	GCC	2	6	11532	11537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_008769	GCAC	2	8	11608	11615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
270	NC_008769	CCG	2	6	11637	11642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_008769	CGA	2	6	11694	11699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_008769	ACT	2	6	11741	11746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_008769	CAT	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_008769	CGG	2	6	12395	12400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_008769	GCCC	2	8	12453	12460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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385	NC_008769	GAT	2	6	16815	16820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
386	NC_008769	CTG	2	6	16866	16871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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389	NC_008769	CGA	2	6	16976	16981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
390	NC_008769	TCC	2	6	16984	16989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
391	NC_008769	CGT	2	6	17057	17062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
392	NC_008769	GGT	2	6	17076	17081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
393	NC_008769	CGG	2	6	17105	17110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_008769	GGCCGC	2	12	17177	17188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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396	NC_008769	TCGA	2	8	17220	17227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
397	NC_008769	CGT	2	6	17264	17269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
398	NC_008769	GAC	2	6	17310	17315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_008769	CTG	2	6	17346	17351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
400	NC_008769	CCG	2	6	17401	17406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
401	NC_008769	CCG	2	6	17437	17442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
402	NC_008769	GGC	2	6	17480	17485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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404	NC_008769	CGG	2	6	17504	17509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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408	NC_008769	CTG	2	6	17667	17672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_008769	ACC	2	6	18228	18233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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